本發明公開了一種城市富營養化河道生態修復方法,包括:在河道的攔控水閘設置攔控水位系統;在主河道,將清淤的土方堆成沿河緩坡、河心島嶼,岸坡比為1∶2.5~1∶5,從河道堤壩往河道中央依次形成淺水區和深水闊水區;對所述沿河緩坡的坡面進行堆石型和插孔式混凝土塊型底型改造;在河心島嶼、底型改造后的沿河緩坡構建堤岸帶水生植物帶,在沿堤岸帶構建植物浮床生物帶;在疏浚后的河道放流濾雜食性魚類和貝類、蝦類動物。采用本發明的修復方法,河道水質從IV~V類提高到III類以上水質,水域生物多樣性增加2倍以上,河道的調蓄水、泄洪能力更加暢順,水系的補充地下水、固碳釋氧、調節氣候、水源涵養等功能得到進一步提高。