本發明涉及漁業生態恢復和漁業基礎建設領域,一種內陸河流人工魚礁結構,包括人工魚礁主體,所述人工魚礁主體為六邊形結構;所述人工魚礁主體由十八個魚礁單體層疊拼接為三層,每層由六個魚礁單體組成;相鄰的兩個魚礁單體互相顛倒設置;一種內陸河流人工魚礁設計方法,在面積1平方公里方位內的投礁區處放入人工魚礁主體30組;所述投礁區最低水位3m,最高水位15m,流速0.7?3.5m/s,江底為直徑10?20cm的沙石底質。本發明為內陸河流水域魚類,特別是珍稀特有魚類提供繁殖、生長、索餌和避敵的場所,重建魚類棲息地;有效緩解江河水利設施、航道整治和水工建設對生態環境的不利影響;調動水生生態系統自我組織和修復能力,促進生態平衡。